18 сентября 2013 года Госдума все-таки приняла изрядно нашумевший закон о реформировании РАН в окончательном третьем чтении. Отныне имуществом Академии Наук будет управлять специальный орган исполнительной власти, а власть больше не сможет оказывать влияние на ее научную деятельность.
Согласно принятому закону все научные институты, находящиеся сегодня в ведении РАН, РАМН и РАСХН будут переданы под управление специально созданному агентству (за исключением Дальневосточного, Уральского и Сибирского отделений Академии). Кроме того, агентство будет давать государственные задания институтам, находящимся в его ведении, и утверждать руководителей научных институтов, выбранных их коллективами. Примечательно, что федеральное агентство будет находиться в подчинении не у Минобрнауки, как это планировалось ранее, а у правительства. Поэтому, одновременно с принятием закона, Госдума рекомендовала правительству утвердить положение о федеральном агентстве в течение трех месяцев с момента вступления в силу закона о реформировании РАН.
Кстати, в утвержденном законопроекте нет ни одного слова о ликвидации РАМН и РАСХН. Речь идет всего лишь об объединении. Другими словами, новым законом РАМН и РАСХН объединятся с РАН в качестве отдельных юридических лиц. Новая Академия станет федеральным государственным бюджетным учреждением, которое будет заниматься проведением поисковых и фундаментальных научных исследований. При этом властям будет запрещено принимать какие-либо решения, препятствующие выполнению задач и функций Академии, и вмешиваться в ее научную деятельность.